為了提高制藥行業生產和質量管理水平，協會根據國家對醫藥行業不同時期的生產質量要求，針對實施98版、2010版GMP多次組織專題培訓。邀請國內GMP專家對GMP進行理論講解、實例分析、互動答疑、邀請國內已通過GMP認證的企業專業人員介紹經驗、詳細解讀、互動交流，并參觀已通過GMP認證的生產線，為制藥企業在規定時間內順利通過GMP認證提供幫助。使制藥企業總體技術和質量管理水平有全面和顯著地提高。

為促進我國臨床試驗數據管理操作和數據質量水平的整體提升，國家CDE制訂了相關指南和政策，不斷加強臨床試驗全過程動態的監督管理，從多層面規范我國臨床試驗數據管理工作，力爭使我國藥物臨床試驗的數據質量水平與生物醫藥創新戰略的要求相適應，協會配合國家藥監部門開展一系列工作，如：推進仿制藥質量一致性評價；藥品注冊管理辦法修訂等等。